وردت أقوال في ترتيب الآيات والسور،وخلاصة الكلام أن ترتيب الآيات في السورة الواحدة أمرٌ توقيفي ولا خلاف فيه،وقد وردت فيه عدة أحاديث صحيحة، وكان قرّاء الصحابة رضي الله عنهم يقرَأُون ويقرِئون السور من القرآن على ترتيب الآيات الذي تلقّوه عن النبي صلى الله عليه وسلم .
أما ترتيب السور في المصحف فالراجح في المسألة هو قول جمهورهم والمحققين منهم أنّ الصحابة رضي الله عنهم اجتهدوا في ترتيب سور القرآن في المصحف، إلا أنّ هذا الاجتهاد لم يكن مستنده مجرّد الرأي والاستحسان، بل كان قائماً على أصول صحيحة وأدلّة تفصيلية علموها،وقد تلقت الأمة هذا الترتيب بالقبول في زمانهم وبعده على مَرِّ القرون.